Árið 1995 var sjálfsmat grunnskóla lögbundið (Lög um grunnskóla nr. 66/1995). Sjálfsmat Vatnsendaskóla hófst í nóvember 2005 á fyrsta starfsári skólans. Sérstakt teymi hefur haldið utan um sjálfsmat skólans á hverju starfsári. Svokölluð “blönduð aðferðafræði” (mixed methods) er notuð við gagnaöflun í sjálfsmatinu, það er að segja bæði er safnað megindlegum og eigindlegum gögnum.

Sjálfsmat skóla gengur út á stöðuga gagnaöflun meðal hagmunaaðila skólans, úrvinnslu og umbætur en hér að neðan má sjá þær upplýsingar sem liggja fyrir varðandi þrjú fyrstu skólaárin:

1. Sjálfsmatsskýrsla og umbótaáætlun Vatnsendaskóla skólaárið 2008-2009

2. Sjálfsmatsskýrsla og umbótaáætlun Vatnsendaskóla skólaárið 2007-2008

3.  Meistararitgerð við Háskóla Íslands - Sjálfsmat Vatnsendaskóla eftir Sigríði Sigurðardóttur

4.  Glærukynning - Niðurstöður á sjálfsmati Vatnsendaskóla frá hausti 2005 til vors 2007

5.  Drög að matsskýrslu - Niðurstöður foreldrakönnunar sem lögð var fyrir í maí 2006